Alkisah;sejarah singkat Desa Kaliglagah diawali pada kisaran tahun 1930an ketika seorang keluarga keraton Yogyakarta bernama Mbah Kertiyudho terpisah dari rombongannya yang menghindari kejaran penjajah Belanda pada masa penjajahan.Kemudia beliau sampai di kawasan yg sekarang bernama Kaliglagah, akibat adanya bencana alam,beliau terhanyut oleh banjir di sebuah Kali.Upaya penyelamatannya tentu tidaklah mudah,hingga ia tersangkut di rumpun Glagah(sejenis rumpun perdu/rumput beruas namun kecil dan rimbun).
Lalu ia mencoba bertahan hidup dan tinggal di daerah tersebut dan berkeluarga.Setelah sekian waktu,daerah tersebut didiami kurang lebih 4 KK,Mbah Kertiyudho merintis sistem pengaturan wilayah/sebut saja pemerintahan kecil,dan terus berkembang hingga disebutlah DESA KALIGLAGAH. Meski begitu,Kades/Lurah pertama bukanlah beliau.
Hingga saat ini,sudah mengalami beberapa periode kepala desa,diantaranya Mbah Udoleksono/tahun 1940an,Mbah Pawiro,Mbah Tamyis,Mbah Ky.Junaidi,Mbah Syungeb,Pak Soeyudi,Pak Nurkhamid,Pak Pujiyanto,Pak Lepot(2 periode 6 tahunan;2013-2019,2019-2025).
Demikianlah sejarah singkat Desa Kaliglagah menurut penuturan narasumber para sesepuh/tokoh masyarakat yang penulis kumpulkan,yang pada masa tersebut belum terdokumentasikan secara rapi seperti pada era modern saat ini,namun telah dipercaya kebenarannya turun temurun.